- Hidrogeología regional (caracterización hidroquímica e hidrodinámica de sistemas acuíferos, evaluación de recursos, contaminación)
- Implicación medioambiental de la relación aguas subterráneas-humedales. Aplicación a reservas naturales andaluzas
- Hidrogeología y geomorfología kárstica: recursos geoambientales
- Relación agua dulce-agua salada en acuíferos costeros: intrusión marina
- Transporte de contaminantes en la zona no saturada del suelo (vertidos de aguas residuales)
- Drenaje ácido de minas (metales pesados)

- Control de la eutrofización en las aguas en albuferas. Diagnóstico, evaluación y propuesta de recuperación.
- Explotación conjunta de aguas superficiales y subterráneas: modelización de flujo y de contaminantes en acuíferos costeros.
- Elaboración de Guías Geológicas de espacios protegidos: información sobre las formaciones geológicas, itinerarios, y la evaluación de la riqueza geológica
- Caracterización hidrogeológica, hidroquímica e hidrodinámica de aguas subterráneas para su evaluación y gestión